[ Source: minimap2 ]
Paketti: python3-mappy (2.27+dfsg-1 ja muut)
Links for python3-mappy
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti minimap2:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
Python3 interface minimap2
Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.
This package contains the Python3 interface for using minimap2.
Muut pakettiin python3-mappy liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [x32]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.11) [x32]
- dep: python3 (<< 3.13) [ei x32]
- dep: python3 (>= 3.10~) [x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [ei x32]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi python3-mappy
| Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|---|
| alpha (epävirallinen siirros) | 2.26+dfsg-1 | 210.2 kt | 956.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| amd64 | 2.27+dfsg-1 | 175.9 kt | 671.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 2.27+dfsg-1 | 167.3 kt | 695.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armel | 2.27+dfsg-1 | 188.7 kt | 777.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armhf | 2.27+dfsg-1 | 190.7 kt | 561.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| hppa (epävirallinen siirros) | 2.24+dfsg-3+b2 | 209.1 kt | 867.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| i386 | 2.27+dfsg-1 | 225.1 kt | 985.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ia64 (epävirallinen siirros) | 2.24+dfsg-3+b1 | 256.8 kt | 1,500.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| m68k (epävirallinen siirros) | 2.27+dfsg-1 | 187.0 kt | 799.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 2.27+dfsg-1 | 195.8 kt | 977.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64 (epävirallinen siirros) | 2.27+dfsg-1 | 215.4 kt | 1,079.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 2.27+dfsg-1 | 200.1 kt | 951.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 | 2.27+dfsg-1 | 222.9 kt | 679.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| s390x | 2.27+dfsg-1 | 227.8 kt | 955.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sh4 (epävirallinen siirros) | 2.24+dfsg-3+b2 | 233.3 kt | 693.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sparc64 (epävirallinen siirros) | 2.27+dfsg-1 | 183.0 kt | 2,115.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| x32 (epävirallinen siirros) | 2.24+dfsg-2+b1 | 143.0 kt | 341.0 kt | [tiedostoluettelo] |