Paketti: spaln (3.0.2+dfsg-2) [debports]

Links for spaln

Debian-palvelut:

Vikailmoitukset

Imuroi lähdekoodipaketti :

Ei löytynyt

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Muut pakettiin spaln liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

GCC:n apukirjasto
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: spaln-data

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi spaln

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
ppc64 (epävirallinen siirros)	555.4 kt	2,690.0 kt	[tiedostoluettelo]