Paketti: macs (3.0.1-2 ja muut)

Links for macs

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti macs:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Muut pakettiin macs liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: cython3 [x32]

C-Extensions for Python 3
dep: cython3-legacy [alpha, hppa, ppc64, sparc64]

C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, ppc64, sparc64, x32]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.12) [x32]

dep: python3 (<< 3.13) [ei ia64, x32]

dep: python3 (<< 3.9) [ia64]

dep: python3 (>= 3.11~) [ei ia64]

dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]
dep: python3-cykhash [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique
dep: python3-hmmlearn [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models
dep: python3-numpy [alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

Fast array facility to the Python language (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [sh4]
dep: python3-numpy-abi9 [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
dep: python3-scipy [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

scientific tools for Python 3
dep: python3-sklearn [ei alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

Python modules for machine learning and data mining - Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el, riscv64, s390x]

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [m68k, sh4]

Imuroi macs

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.2.9.1-1+b1	3,178.8 kt	11,058.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	3.0.1-2	4,425.1 kt	14,386.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3.0.1-2	3,924.4 kt	14,472.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	3.0.1-2	3,938.0 kt	13,353.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	3.0.1-2	4,036.1 kt	10,033.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	2.2.9.1-1+b1	3,147.9 kt	10,806.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	3.0.1-2	4,419.1 kt	15,630.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	2.2.6-3+b1	2,653.4 kt	11,172.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	3.0.1-2	3,943.7 kt	13,081.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	2.2.9.1-1+b1	3,177.0 kt	11,663.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3.0.1-2	4,251.0 kt	17,997.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	3.0.1-2	4,506.9 kt	11,445.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	3.0.1-2	4,265.3 kt	14,839.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	3.0.1-2	4,869.1 kt	13,307.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	2.2.9.1-1+b1	2,977.6 kt	28,654.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	2.2.9.1-1	2,527.6 kt	5,365.0 kt	[tiedostoluettelo]