[ Source: freebayes ]
Paketti: freebayes (1.3.9-1 ja muut)
Links for freebayes
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti freebayes:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Brad Chapman (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping
FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.
Muut pakettiin freebayes liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, ppc64, sparc64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 14.2.0-17) [loong64]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]
- C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
- dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [ei amd64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei alpha]
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
- dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-16) [alpha]
-
- dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]
- C++ wrapper to tabix indexer
-
- dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0) [ei ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]
- C++ wrapper to tabix indexer
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
-
- dep: libvcflib2 (>= 1.0.12+dfsg) [ei ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- rec: parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel
Imuroi freebayes
| Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|---|
| alpha (epävirallinen siirros) | 1.3.9-1 | 1,470.2 kt | 4,306.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| amd64 | 1.3.9-1 | 1,487.6 kt | 4,126.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 1.3.9-1 | 1,426.3 kt | 4,045.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ia64 (epävirallinen siirros) | 1.3.6-2+b1 | 1,561.5 kt | 5,564.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| loong64 (epävirallinen siirros) | 1.3.9-1 | 1,462.4 kt | 4,173.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| m68k (epävirallinen siirros) | 1.3.6-2+b1 | 1,396.9 kt | 3,912.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 1.3.9-1 | 1,470.3 kt | 4,437.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64 (epävirallinen siirros) | 1.3.6-2+b1 | 1,458.5 kt | 4,480.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 1.3.9-1 | 1,503.2 kt | 4,430.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 | 1.3.9-1 | 1,489.8 kt | 3,774.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sh4 (epävirallinen siirros) | 1.3.6-2+b1 | 1,531.0 kt | 3,898.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sparc64 (epävirallinen siirros) | 1.3.6-2+b1 | 1,354.8 kt | 4,621.0 kt | [tiedostoluettelo] |