[ Source: anfo ]
Paketti: anfo (0.98-9)
Links for anfo
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti anfo:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [bioinf.eva.mpg.de]
Samankaltaisia paketteja:
Short Read Aligner/Mapper from MPG
Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).
Muut pakettiin anfo liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libanfo0 (>= 0.98)
- Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
-
- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]
-
- dep: libelk0
- implementation of Scheme (the Extension Language Kit)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libpopt0 (>= 1.14)
- kirjasto komentoriviparametrien jäsentämiseen
-
- dep: libprotobuf17 [ia64]
- protocol buffers C++ library
-
- dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4) [ei ia64]
- protocol buffers C++ library
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi anfo
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| alpha (epävirallinen siirros) | 113.7 kt | 446.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| amd64 | 113.9 kt | 439.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 105.0 kt | 395.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armel | 100.0 kt | 345.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armhf | 101.9 kt | 305.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| hppa (epävirallinen siirros) | 115.0 kt | 387.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| i386 | 119.5 kt | 413.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ia64 (epävirallinen siirros) | 135.6 kt | 620.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| m68k (epävirallinen siirros) | 113.7 kt | 405.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 109.6 kt | 438.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64 (epävirallinen siirros) | 115.0 kt | 619.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 114.9 kt | 619.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 (epävirallinen siirros) | 109.9 kt | 361.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| s390x | 104.1 kt | 411.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sh4 (epävirallinen siirros) | 125.5 kt | 383.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sparc64 (epävirallinen siirros) | 100.0 kt | 418.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| x32 (epävirallinen siirros) | 113.9 kt | 389.0 kt | [tiedostoluettelo] |