Paketti: samtools (1.19.2-1 ja muut) [debports]

Links for samtools

Debian-palvelut:

Vikailmoitukset

Imuroi lähdekoodipaketti :

Ei löytynyt

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [www.htslib.org]

Samankaltaisia paketteja:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Muut pakettiin samtools liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6.1 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

jaetut kirjastot päätteen hallintaan
dep: libtinfo6 (>= 6)

Jaettu matalan abstraktiotason terminfo-kirjasto päätteen käsittelyyn
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Imuroi samtools

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.19.2-1+b1	626.8 kt	1,800.0 kt	[tiedostoluettelo]