Tarkennettu haku
experimental  ]
[ Source: libssw  ]

Paketti: libssw1 (1.2.5-1)

Links for libssw1

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti libssw:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Muut pakettiin libssw1 liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances
  • dep: libc6 (>= 2.17)
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
    GCC:n apukirjasto
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
  • dep: zlib1g
    pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libssw1

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
ppc64el 19.7 kt84.0 kt [tiedostoluettelo]