Tarkennettu haku
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: bwa  ]

Paketti: bwa (0.7.17-8~0exp)

Links for bwa

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti bwa:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Tagit: Biology: Proteins, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

Muut pakettiin bwa liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
  • rec: perl
    Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
  • sug: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi bwa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
ppc64el 226.8 kt576.0 kt [tiedostoluettelo]