[ Source: kissplice ]
Paketti: kissplice (2.4.0-p1-4)
Links for kissplice
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti kissplice:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- David Parsons (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [kissplice.prabi.fr]
Samankaltaisia paketteja:
Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data
KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.
Muut pakettiin kissplice liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.27)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (Python2 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi kissplice
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| arm64 | 755.5 kt | 1,334.0 kt | [tiedostoluettelo] |