Paketti: python3-pairtools (0.3.0-2 ja muut)

Links for python3-pairtools

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti pairtools:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Muut pakettiin python3-pairtools liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: cython3

C-Extensions for Python 3
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-nose

test discovery and running for Python3 unittest
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language

Imuroi python3-pairtools

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.3.0-2+b2	121.3 kt	440.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.3.0-2+b2	110.5 kt	407.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.3.0-2+b2	109.3 kt	394.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.3.0-2+b2	109.4 kt	342.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.3.0-2+b2	119.7 kt	426.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.3.0-2+b2	108.1 kt	437.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	0.3.0-2+b2	108.0 kt	414.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.3.0-2+b2	120.3 kt	479.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.3.0-2+b2	107.5 kt	415.0 kt	[tiedostoluettelo]