Paketti: gmap (2021-02-22+ds-1)

Links for gmap

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti gmap:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [research-pub.gene.com]

Samankaltaisia paketteja:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).

GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Tagit: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Muut pakettiin gmap liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: perl

Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi gmap

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
mips64el	5,324.5 kt	54,666.0 kt	[tiedostoluettelo]