[ Source: seqan-raptor ]
Paketti: seqan-raptor (2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3)
Links for seqan-raptor
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti seqan-raptor:
- [seqan-raptor_2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3.dsc]
- [seqan-raptor_2.0.0.0.git.fecfbca+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Muut pakettiin seqan-raptor liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 12)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi seqan-raptor
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 591.3 kt | 2,858.0 kt | [tiedostoluettelo] |