[ Source: libbio-db-hts-perl ]
Paketti: libbio-db-hts-perl (3.01-4 ja muut)
Links for libbio-db-hts-perl
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti libbio-db-hts-perl:
- [libbio-db-hts-perl_3.01-4.dsc]
- [libbio-db-hts-perl_3.01.orig.tar.gz]
- [libbio-db-hts-perl_3.01-4.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [metacpan.org]
Samankaltaisia paketteja:
Perl interface to the HTS library
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
This package provides a Perl interface to the HTS library.
Muut pakettiin libbio-db-hts-perl liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl core perl modules
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: perl (>= 5.36.0-4)
- Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
-
- dep: perlapi-5.36.0
- näennäispaketti, jonka toteuttaa perl-base
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi libbio-db-hts-perl
| Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|---|
| mipsel | 3.01-4+b1 | 143.4 kt | 558.0 kt | [tiedostoluettelo] |