Paketti: cd-hit (4.8.1-4)

Links for cd-hit

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti cd-hit:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [weizhongli-lab.org]

Samankaltaisia paketteja:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Muut pakettiin cd-hit liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC:n apukirjasto
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: perl

Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi cd-hit

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
mipsel	511.2 kt	1,541.0 kt	[tiedostoluettelo]