[ Source: htslib ]
Paketti: libhts3 (1.16+ds-3)
Links for libhts3
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti htslib:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Charles Plessy (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Michael R. Crusoe (Laadunvalvontasivu)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
- Étienne Mollier (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
C library for high-throughput sequencing data formats
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
Muut pakettiin libhts3 liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)
-
- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
-
- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto
-
- dep: libssl3 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer -työkalupakki - jaetut kirjastot
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi libhts3
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| amd64 | 419.5 kt | 1,044.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 382.7 kt | 1,188.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armel | 363.8 kt | 1,123.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| armhf | 366.2 kt | 931.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| i386 | 458.0 kt | 1,151.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 377.8 kt | 1,301.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mipsel | 393.9 kt | 1,293.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 453.9 kt | 1,511.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| s390x | 381.5 kt | 1,076.0 kt | [tiedostoluettelo] |