Paket: r-bioc-edger (4.0.16+dfsg-1)

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Externe Ressourcen:

Homepage [bioconductor.org]

Empirische Analyse von digitalen Genexpressionsdaten mit R

Bioconductor-Paket zur Differentialexpressionsanalyse eines vollkommen sequenzierten Transkriptom (RNA-seq) und digitalen Genexpressionsprofilen mit biologischer Replikation. Es verwendet empirische Bayes-Methoden und exakte Tests, die auf der negativen Binomialverteilung basieren. Es ist auch für die Differentialsignalanalyse mit anderen Typen von Zähldaten in der Größenordnung von Genomen verwendbar.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::r, interface::commandline, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-edger

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC Support-Bibliothek
dep: liblapack3

Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

oder liblapack.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.18

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
dep: r-bioc-limma (>= 3.41.5)

linear models for microarray data
dep: r-cran-locfit

GNU R local regression, likelihood and density estimation
dep: r-cran-rcpp

GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

sug: r-bioc-annotationdbi

GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
sug: r-bioc-biobase

base functions for Bioconductor
sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-org.hs.eg.db

genome-wide annotation for Human
sug: r-bioc-rhdf5

BioConductor HDF5 interface to R
sug: r-bioc-summarizedexperiment

BioConductor assay container
sug: r-cran-jsonlite

Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-matrix

GNU R - Paket von Klassen für dicht und dünn besetzte Matrizen
sug: r-cran-readr

GNU R package to read rectangular text data
sug: r-cran-seuratobject

GNU R data structures for single cell data

r-bioc-edger herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armhf	1.108,0 kB	1.379,0 kB	[Liste der Dateien]