Quellcode-Paket: q2-quality-control (2024.2.0-2)
Links für q2-quality-control
Debian-Ressourcen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
Die folgenden Binärpakete werden aus diesem Quellcode-Paket gebaut:
- q2-quality-control
- QIIME 2 plugin for quality assurance of feature and sequence data
Andere Pakete mit Bezug zu q2-quality-control
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- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Paket nicht verfügbar
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- adep:
dh-sequence-python3
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch
dh-python
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- adep:
python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- adep:
python3-setuptools
- Erweiterungen für die Python3 Distutils
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- adep:
python3-pytest-cov
- py.test-Plugin zum Erstellen von Berichten zur Testabdeckung für Python3
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- adep:
python3-biom-format
- Biological Observation Matrix (BIOM) format (Python 3)
-
- adep:
python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
-
- adep:
python3-numpy
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- adep:
python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
-
- adep:
python3-scipy
(>= 1.10~)
- Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3
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- adep:
python3-seaborn
- statistical visualization library for Python3
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- adep:
qiime
(>= 2024.2)
- Quantitative Insights Into Microbial Ecology
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- adep:
q2templates
(>= 2024.2)
- Design template package for QIIME 2 Plugins
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- adep:
q2-taxa
(>= 2024.2)
- QIIME 2 plugin for working with feature taxonomy annotations
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- adep:
q2-feature-table
(>= 2024.2)
- QIIME 2 plugin supporting operations on feature tables
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- adep:
r-base-core
- GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
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- adep:
bowtie2
- Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen
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- adep:
ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- adep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- adep:
vsearch
- tool for processing metagenomic sequences
