Paket: srst2 (0.1.8-1) [debports]

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Nicht gefunden

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [katholt.github.io]

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens

This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.

Andere Pakete mit Bezug zu srst2

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: bowtie2

Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen
dep: cd-hit

Programme zur schnellen Gruppierung von Sequenzen
dep: python

Paket nicht verfügbar
dep: python-biopython

Python-Bibliothek für die Bioinformatik (implementiert in Python 2)
dep: python-scipy

Paket nicht verfügbar
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

srst2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
x32 (inoffizielle Portierung)	58,6 kB	258,0 kB	[Liste der Dateien]