Paket: python3-pyspoa (0.2.1-2 und andere)

Links für python3-pyspoa

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket python-pyspoa herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Andere Pakete mit Bezug zu python3-pyspoa

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.32) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [ia64]

SIMD partial order alignment library

dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [nicht ia64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht ia64, m68k]
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.14) [nicht ia64]

dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

dep: python3 (>= 3.13~) [nicht ia64]

python3-pyspoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	59,9 kB	218,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.2.1-2+b1	63,8 kB	180,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.2.1-2+b1	57,1 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.2.1-2+b1	55,7 kB	215,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.2.1-2+b1	56,9 kB	151,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	62,7 kB	187,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.2.1-2+b1	68,0 kB	175,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	90,3 kB	498,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	59,2 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	58,9 kB	159,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.2.1-2+b1	58,8 kB	223,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	63,8 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.2.1-2+b1	64,6 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.2.1-2+b1	61,3 kB	140,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.2.1-2+b1	62,9 kB	180,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	75,8 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	53,1 kB	1.053,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.2.1-2+b1	63,8 kB	167,0 kB	[Liste der Dateien]