Paket: python3-pyspoa (0.0.10-1 und andere)

Links für python3-pyspoa

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Quellcode-Paket python-pyspoa herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Andere Pakete mit Bezug zu python3-pyspoa

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.32) [nicht alpha, ia64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]

SIMD partial order alignment library

dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [nicht amd64, riscv64]

dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: python3 (<< 3.13)

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (>= 3.11~)

python3-pyspoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	71,9 kB	413,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.0.10-1+b1	77,4 kB	289,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.0.10-1+b1	67,2 kB	281,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.0.10-1+b1	64,4 kB	255,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.0.10-1+b1	67,3 kB	191,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	77,2 kB	309,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.0.10-1+b1	81,4 kB	283,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	90,3 kB	498,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	72,5 kB	263,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.0.10-1+b1	71,1 kB	421,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	76,0 kB	409,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.0.10-1+b1	77,5 kB	409,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.0.10-1+b2	73,0 kB	225,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.0.10-1+b1	76,8 kB	297,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	91,7 kB	281,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	64,3 kB	2.083,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.0.10-1+b1	77,4 kB	267,0 kB	[Liste der Dateien]