[ Quellcode: megadepth ]
Paket: megadepth (1.2.0-4 und andere)
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Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
Andere Pakete mit Bezug zu megadepth
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- dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)
- C library for handling bigWig files
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- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]
- Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0) [sparc64]
- Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
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- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
megadepth herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 78,4 kB | 276,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 1.2.0-4+b1 | 81,0 kB | 275,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 1.2.0-4+b2 | 72,4 kB | 275,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 1.2.0-4+b1 | 70,9 kB | 234,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 1.2.0-4+b1 | 72,5 kB | 178,0 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 80,2 kB | 252,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 1.2.0-4+b1 | 84,1 kB | 274,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 99,7 kB | 467,0 kB | [Liste der Dateien] |
| loong64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 74,2 kB | 260,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 1.2.0-4+b1 | 71,9 kB | 282,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 81,5 kB | 339,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 1.2.0-4+b1 | 83,3 kB | 339,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 1.2.0-4+b2 | 79,8 kB | 219,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 1.2.0-4+b1 | 82,1 kB | 271,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 91,8 kB | 275,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc64 (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 70,2 kB | 1.047,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 1.2.0-4+b1 | 83,8 kB | 258,0 kB | [Liste der Dateien] |