Paket: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 und andere)
Links für libfastahack-dev
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket libfastahack herunterladen:
- [libfastahack_1.0.0+dfsg-11.dsc]
- [libfastahack_1.0.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libfastahack_1.0.0+dfsg-11.debian.tar.xz]
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)
fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.
Features:
* FASTA index (.fai) generation for FASTA files * Sequence extraction * Subsequence extraction * Sequence statistics (currently only entropy is provided)
Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.
This is the development package containing the statically linked library and the header files.
Andere Pakete mit Bezug zu libfastahack-dev
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- dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [nicht riscv64]
- library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)
- dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b1) [riscv64]
libfastahack-dev herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|---|
alpha (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 29,4 kB | 170,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 1.0.0+dfsg-11 | 27,8 kB | 120,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 1.0.0+dfsg-11 | 26,1 kB | 118,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 1.0.0+dfsg-11 | 27,0 kB | 109,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 1.0.0+dfsg-11 | 27,1 kB | 96,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 27,6 kB | 99,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 1.0.0+dfsg-11 | 29,3 kB | 104,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 33,3 kB | 165,0 kB | [Liste der Dateien] |
m68k (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 26,3 kB | 100,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 1.0.0+dfsg-11 | 29,1 kB | 140,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 28,0 kB | 125,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 1.0.0+dfsg-11 | 28,2 kB | 124,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 1.0.0+dfsg-11+b1 | 82,2 kB | 721,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 1.0.0+dfsg-11 | 27,5 kB | 121,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 29,9 kB | 97,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 23,5 kB | 111,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 1.0.0+dfsg-11 | 27,7 kB | 102,0 kB | [Liste der Dateien] |