Paket: embassy-domalign (0.1.660-5 und andere)

Links für embassy-domalign

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Quellcode-Paket embassy-domalign herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [emboss.sourceforge.net]

Zusätzliche EMBOSS-Befehle für Alignments mit Proteindomänen

Die DOMALIGN-Programme wurden von Jon Ison et al. am MRC HGMP für deren Forschung im Bereich der Proteindomänen entwickelt. Diese Programme sind als ein EMBASSY-Paket enthalten, die Entwicklung ist jedoch noch nicht abgeschlossen.

Anwendungen der aktuellen domalign-Veröffentlichung sind allversusall (Daten von Sequenzähnlichkeiten von einem Alle-gegen-Alle-Vergleich), domalign (erstellt Alignments (DAF-Datei) für Knoten in einer DCF-Datei), domainrep (sortiert DCF-Dateien neu, um repräsentative Strukturen zu identifizieren) und seqalign (erweitert Alignments (DAF-Datei) mit Sequenzen (DHF-Datei)).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Anwendungs-Suite: suite::TODO, use::analysing, Zweck: Vergleichen, Bearbeiten, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu embassy-domalign

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

EMBOSS-Bibliotheken

dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg)
dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, loong64, m68k, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libx11-6

Clientseitige X11-Bibliothek

rec: emboss

Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

sug: embassy

Paket nicht verfügbar

embassy-domalign herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.1.660-5	65,5 kB	792,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.1.660-5	65,9 kB	616,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.1.660-5+b1	64,9 kB	793,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.1.660-4	65,8 kB	593,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.1.660-5	69,6 kB	637,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	0.1.660-5	64,7 kB	616,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.1.660-4	67,0 kB	597,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.1.660-5	64,3 kB	795,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.1.660-5	65,9 kB	792,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.1.660-5	66,4 kB	792,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.1.660-5	64,3 kB	592,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.1.660-4	68,4 kB	589,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.1.660-5	64,5 kB	4.638,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.1.660-4	66,4 kB	597,0 kB	[Liste der Dateien]