Paket: r-bioc-fmcsr (1.44.0+dfsg-1) [debports]

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GNU R mismatch tolerant maximum common substructure searching

The fmcsR package introduces an efficient maximum common substructure (MCS) algorithms combined with a novel matching strategy that allows for atom and/or bond mismatches in the substructures shared among two small molecules. The resulting flexible MCSs (FMCSs) are often larger than strict MCSs, resulting in the identification of more common features in their source structures, as well as a higher sensitivity in finding compounds with weak structural similarities. The fmcsR package provides several utilities to use the FMCS algorithm for pairwise compound comparisons, structure similarity searching and clustering.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-fmcsr

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6.1 (>= 2.1.3)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.18

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
dep: r-bioc-biocgenerics

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-chemminer

Cheminformatics Toolkit for R
dep: r-cran-runit

GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown

Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

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