Paket: cd-hit (4.8.1-4) [debports]

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Programme zur schnellen Gruppierung von Sequenzen

cd-hit enthält eine Anzahl an Programmen, um Sequenzen zu gruppieren. cd-hit gruppiert Proteine zu Clustern, die eine benutzerdefinierte Ähnlichkeitsschwelle einhalten. cd-hit-est ähnelt cd-hit, gruppiert allerdings Nukleotidsequenzen (ohne Introns). cd-hit-est2 ähnelt cd-hit-est, vergleicht jedoch zwei Nukleotid-Datensätze. Eine Anzahl an weiteren zugehörigen Programmen sind ebenfalls in diesem Paket enthalten. Weitere Informationen finden Sie im Benutzerhandbuch von cd-hit, das auch Teil dieses Pakets ist.

Andere Pakete mit Bezug zu cd-hit

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6.1 (>= 2.7)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC Support-Bibliothek
dep: libgomp1 (>= 6)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	505,8 kB	1.531,0 kB	[Liste der Dateien]