Paket: probcons (1.12-12)

Links für probcons

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Quellcode-Paket probcons herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [probcons.stanford.edu]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu probcons

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.27)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

sug: probcons-extra

Extraprogramme des probcons Paketes

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

probcons herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	113,1 kB	366,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	108,5 kB	318,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	93,9 kB	237,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	101,5 kB	341,0 kB	[Liste der Dateien]