Paket: tabix (1.9-12~deb10u1)

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Allgemeiner Indexierer für tabulator-getrennte Genom-Positions-Dateien

Tabix indexiert Dateien, wobei Spalten zur Definition der Sequenzkoordinaten genutzt werden: Name (für gewöhnlich ein Chromosom), Beginn und Ende. Die Eingabedatei muss positionssortiert und mittels bgzip (welches eine gzip ähnliche Schnittstelle besitzt und von diesem Paket bereitgestellt wird) komprimiert sein. Nach der Indexierung ist tabix imstande zügig Datenzeilen anhand von Chromosomenkoordinten abzufragen. Schnelle Datenabfragung ist ebenfalls über ein Netzwerk möglich, wenn eine URI als Dateiname angegeben ist.

Diese Version von tabix wurde aus den HTSlib-Quellen erstellt.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm, Wissenschaft: science::calculation, use::calculating, Unterstützt Formate: HTML, Hypertext Markup Language (Hypertext-Auszeichnungssprache), Arbeitet mit: Text

Andere Pakete mit Bezug zu tabix

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.15)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

tabix herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armhf	256,2 kB	616,0 kB	[Liste der Dateien]