Paket: r-cran-sctransform (0.3.2-1)

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Externe Ressourcen:

Homepage [cran.r-project.org]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-sctransform

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: liblapack3

Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

oder liblapack.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armhf]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 9) [nicht armhf]
dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
dep: r-cran-future

R package: A Future API for R
dep: r-cran-future.apply

apply function to elements in parallel using futures
dep: r-cran-ggplot2

Implementierung der »Grammar of Graphics«
dep: r-cran-gridextra

GNU R: Erweiterungen für das grid-Paket
dep: r-cran-mass

GNU-R-Paket für MASS von Venables und Ripley
dep: r-cran-matrix

GNU R - Paket von Klassen für dicht und dünn besetzte Matrizen
dep: r-cran-matrixstats

GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix
dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++
dep: r-cran-rcpparmadillo

GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library
dep: r-cran-reshape2

Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

rec: r-cran-testthat

GNU R testsuite

sug: r-cran-irlba

GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

r-cran-sctransform herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	388,8 kB	587,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	377,8 kB	567,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	379,0 kB	509,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	393,0 kB	589,0 kB	[Liste der Dateien]