Paket: spoa (4.0.7+ds-1 und andere)

Links für spoa

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket spoa herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5+ds)

SIMD partial order alignment library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	4.0.7+ds-1+b1	37,1 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]