Paket: r-bioc-dss (2.46.0+dfsg-2)

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Externe Ressourcen:

Homepage [bioconductor.org]

Bioconductor dispersion shrinkage for sequencing data

DSS is an R library performing differntial analysis for count-based sequencing data. It detectes differentially expressed genes (DEGs) from RNA-seq, and differentially methylated loci or regions (DML/DMRs) from bisulfite sequencing (BS-seq). The core of DSS is a new dispersion shrinkage method for estimating the dispersion parameter from Gamma-Poisson or Beta-Binomial distributions.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-dss

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dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
dep: r-bioc-biobase

base functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-bsseq

Bioconductor analyze, manage and store bisulfite sequencing data

sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown

Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
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armhf	592,5 kB	2.044,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	592,9 kB	1.992,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	592,9 kB	2.045,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	592,8 kB	2.044,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	593,8 kB	2.044,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	593,0 kB	1.988,0 kB	[Liste der Dateien]