Paket: python3-pyani (0.2.12-2)

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Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Python3 module for average nucleotide identity analyses

Pyani is a Python3 module and script that provides support for calculating average nucleotide identity (ANI) and related measures for whole genome comparisons, and rendering relevant graphical summary output. Where available, it takes advantage of multicore systems, and can integrate with SGE/OGE-type job schedulers for the sequence comparisons.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-pyani

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: mummer

Effizientes Sequenzalignment vollständiger Genome
dep: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-biopython

Python-3-Bibliothek für die Bioinformatik
dep: python3-matplotlib

Python-3-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen
dep: python3-pandas

data structures for "relational" or "labeled" data
dep: python3-scipy

Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3
dep: python3-seaborn

statistical visualization library for Python3
dep: python3-setuptools

Erweiterungen für die Python3 Distutils

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
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armhf	47,0 kB	207,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	47,0 kB	207,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	47,0 kB	207,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	47,0 kB	207,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	47,0 kB	207,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	47,0 kB	207,0 kB	[Liste der Dateien]