Paket: libbio-samtools-perl (1.43-3 und andere)

Links für libbio-samtools-perl

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [metacpan.org]

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Markierungen: Software-Entwicklung: Perl-Entwicklung, Bibliotheken, Implementiert in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Rolle: Entwicklungs-Bibliothek, Laufzeit-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libbio-samtools-perl

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbio-perl-perl

Grundlegende Perl-Module von BioPerl
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: perl (>= 5.36.0-4)

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
dep: perlapi-5.36.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch perl-base
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

enh: gbrowse

GMODs Generic Genome Browser
enh: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

libbio-samtools-perl herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64el	1.43-3+b3	192,6 kB	754,0 kB	[Liste der Dateien]