[ Quellcode: libbio-db-hts-perl ]
Paket: libbio-db-hts-perl (3.01-4 und andere)
Links für libbio-db-hts-perl
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket libbio-db-hts-perl herunterladen:
- [libbio-db-hts-perl_3.01-4.dsc]
- [libbio-db-hts-perl_3.01.orig.tar.gz]
- [libbio-db-hts-perl_3.01-4.debian.tar.xz]
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [metacpan.org]
Ähnliche Pakete:
Perl interface to the HTS library
HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.
HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.
This package provides a Perl interface to the HTS library.
Andere Pakete mit Bezug zu libbio-db-hts-perl
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- dep: libbio-perl-perl
- Grundlegende Perl-Module von BioPerl
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- dep: libc6 (>= 2.22)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: perl (>= 5.36.0-4)
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
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- dep: perlapi-5.36.0
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch perl-base
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
libbio-db-hts-perl herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| ppc64el | 3.01-4+b1 | 150,9 kB | 552,0 kB | [Liste der Dateien] |