[ Quellcode: htslib ]
Paket: libhts3 (1.16+ds-3)
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Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
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- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.
HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.
Andere Pakete mit Bezug zu libhts3
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- dep: libbz2-1.0
- Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat
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- dep: libssl3 (>= 3.0.0)
- Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
libhts3 herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| arm64 | 382,7 kB | 1.188,0 kB | [Liste der Dateien] |