[ Quellcode: cyvcf2 ]
Paket: python3-cyvcf2 (0.30.18-1 und andere)
Links für python3-cyvcf2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket cyvcf2 herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Liubov Chuprikova (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
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- dep: python3-click
- Wrapper um optparse für Befehlszeilenprogramme - Python 3.x
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- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
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- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)
- Schnelle Array-Einrichtung für die Sprache Python 3
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- dep: python3-numpy-abi9
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy
python3-cyvcf2 herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.30.18-1+b2 | 783,8 kB | 4.710,0 kB | [Liste der Dateien] |