Paket: mecat2 (0.0+git20200428.f54c542+ds-3)

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Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

ultra-fast and accurate de novo assembly tools for SMRT reads

An improved version of MECAT. It is an ultra-fast and accurate mapping and error correcting de novo assembly tools for single molecula sequencing (SMRT) reads. MECAT2 consists of the following three modules:

 1. mecat2map: a fast and accurate alignment tool for SMRT reads.
 2. mecat2cns: correct noisy reads based on their pairwise overlaps.
 3. fsa: a string graph based assembly tool.

Andere Pakete mit Bezug zu mecat2

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 6)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

mecat2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	749,5 kB	4.053,0 kB	[Liste der Dateien]