Package: topp (2.6.0+cleaned1-4 and others) [debports]
Links for topp
Debian Resources:
Download Source Package :
Not foundMaintainers:
External Resources:
- Homepage [www.openms.de]
Similar packages:
Sæt af programmer der implementerer OpenMS Proteomic Pipeline
TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) er en datakanal for analyse af HPLC/MS-data. Programmet består af et sæt af mange små programmer, som kan kædes sammen for at oprette analysedatakanaler skræddersyet for et specifik problem. Programmerne gør brug af biblioteket libopenms. Nogle eksempler på disse programmer er:
- TOPPView: En fremviser for massespektrometri-data. - TOPPAS: En assistent for grafisk brugerflade-drevne TOPP- arbejdsforløbdesign. - DTAExtractor: Udtrækker spektra for en MS-kørselsfil til flere filer i DTA-format. - FileConverter: Konverterer mellem forskellige MS-filformater. - FileFilter: Udtrækker eller manipulerer dele af data fra peak-, feature- eller consensus feature-filer. - SpectraMerger - Sammenføjer spectra fra et LC/MS-kort, enten efter precursor eller efter RT-blokke. - BaselineFilter - Fjerner basislinjen fra profilspectra med brug af et top-hat-filter. - InternalCalibration: Anvender en intern kalibrering. - PTModel: Træner en model for forudsigelse af proteotypic peptider fra et træningssæt. - RTPredict: Forudser retentiontider for peptider med en model trænet af RTModel. - ExecutePipeline: Kør arbejdsforløb oprettet med TOPPAS.
Other Packages Related to topp
|
|
|
|
-
- dep: coinor-libcbc3.1 (>= 2.10.11+ds1)
- Coin-or branch-and-cut-blandet heltalsprogrammeringsløser - delte biblioteker
-
- dep: coinor-libcgl1 (>= 0.60.8+ds)
- COIN-OR Cut Generation-bibliotek
-
- dep: coinor-libclp1 (>= 1.17.9+ds)
- Coin-or lineær programmeringsløser - delte biblioteker
-
- dep: coinor-libcoinutils3v5 (>= 2.11.4+repack1)
- COIN-OR-samling af redskabsklasser - binære filer og biblioteker
-
- dep: coinor-libosi1v5 (>= 0.108.9+ds)
- COIN-OR Open Solver Interface
-
- dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0)
- sæt af dato-tid biblioteker baseret på generiske programmeringskoncepter
-
- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)
- Bibliotek for Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-math1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost.Math Library
-
- dep: libboost-regex1.83.0-icu72
- virtual package provided by libboost-regex1.83.0
-
- dep: libbz2-1.0
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)
- nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libglpk40 (>= 4.65)
- lineært programmeringssæt med heltalsunderstøttelse (MIP)
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libhdf5-103-1t64
- HDF5 C-kørselstidsfiler - seriel version
-
- dep: libhdf5-cpp-103-1t64 (>= 1.10.5)
- HDF5 C++-kørselstidsfiler - seriel version
-
- dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b2)
- Bibliotek for LC/MS-datahåndtering og analyse - kørselstid
-
- dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3)
- Qt 5 - basismodul
-
- dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3)
- Qt 5 GUI-modul
- or libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)
- Qt 5 GUI-modul - OpenGL ES-variant
-
- dep: libqt5network5t64 (>= 5.11.3)
- Qt 5 - netværksmodul
-
- dep: libqt5svg5 (>= 5.11.3)
- Qt 5 SVG-modul
-
- dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3)
- Qt 5 - kontrolmodul
-
- dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)
- Delt bibliotek til SQLite 3
-
- dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libsvm3 (>= 3.21+ds)
- biblioteksimplementering der understøtter vektormaskiner
-
- dep: libsz2 (>= 1.1.3)
- Adaptive Entropy Coding library - SZIP
-
- dep: libwildmagic5 (>= 5.17)
- libraries for mathematics, physics, numerical methods - runtime
-
- dep: libxerces-c3.2t64
- validating XML parser library for C++
-
- dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4)
- Pakke for LC/MS-datahåndtering og -analyse - delte data
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- sug: openms-doc
- Pakke for LC/MS-datahåndtering og analyse - dokumentation
Download topp
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
sparc64 (unofficial port) | 2.6.0+cleaned1-4+b2 | 3,340.0 kB | 184,771.0 kB | [list of files] |