Package: bwa (0.7.17-7 and others) [debports]
Links for bwa
Debian Resources:
Download Source Package :
Not foundMaintainers:
External Resources:
- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Similar packages:
Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er en programpakke, for oversættelse af lavafvigende sekvenser mod en stor referencearvemasse, såsom den menneskelige arvemasse. Den består af tre algoritmer: BWA-backtrack, BWA-SW og BWA-MEM. Den første algoritme er designet for Illunina-sekvenslæsninger op til 100 bp, mens de sidste to er for længere sekvenser fra 70 bp til 1 Mbp. BWA-MEM og BWA-SW deler funktioner såsom understøttelse af long-read og opdelingssammenligning, men BWA-MEM, som er den seneste, anbefales generelt for højkvalitets forespørgsler, da den er hurtigere og mere præcis. BWA-MEM har også bedre ydelse end BWA-backtrack for 70-100 bp Illumina-læsninger.
Other Packages Related to bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- sug: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
Download bwa
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| sparc64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 182.7 kB | 1,093.0 kB | [list of files] |