Package: cct-examples (1:1.0.3-1)

Eksempler på data til test af pakken cct

CGView Comparison Tool (CCT) er en pakke til visuelt at sammenligne bakterie-, plasmid-, chloroplast- eller mitokondrie-sekvenser af interesse for eksisterende genomer eller sekvenssamlinger. Sammenligningerne udføres via BLAST og BLAST-resultaterne præsenteres i form af grafiske kort, som også kan vise sekvensfunktioner, gen- og proteinnavne, COG-kategoritildelinger og sekvenssammensætningskarakteristika. CCT kan oprette kort i en række størrelser, inklusive 400 Megapixel kort egnet for plakater. Sammenligninger kan udføres indenfor en bestemt art eller familie, eller alle tilgængelige genomer kan bruges. Hele kortoprettelsesprocessen, fra at hente sekvenser til at gentegne kort med zoom, kan nemt fuldføres via skripter inkluderet i CCT'en. Brugerdefinerede funktioner eller analyseresultater kan inkluderes på kort, og kort kan tilpasses på mange måder. For at forenkle programopsætning er en CCT-virtuel maskine, som inkluderer alle afhængigheder installeret på forhånd tilgængelig. Detaljerede øvelser, der illustrerer brugen af CCT, er indeholdt i CCT-dokumentationen.

Denne pakke tilbyder dataene, som kan bruges som eksempler. Disse er de samme data som bruges i autopkgtest.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):