Package: python3-bx (0.11.0-4)

Links for python3-bx

Debian Resources:

Download Source Package python-bx:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.11)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

dep: python3 (<< 3.13)

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-lzo

Pythonbindinger for LZO-datakompressionsbiblioteket - Python 3
dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
dep: python3-numpy-abi9

virtual package provided by python3-numpy
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download python3-bx

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	1,065.1 kB	5,977.0 kB	[list of files]