Package: srst2 (0.2.0-12) [debports]

Links for srst2

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [katholt.github.io]

Similar packages:

Kort læsesekvensindtastning for bakterielle patogener

Dette program er designet til at bruge Illumina-sekvensdata, en MLST-database og/eller en database med gensekvenser (f.eks. resistente gener, virulensgener etc.) og rapportere tilstedeværelsen af ST'er og/eller referencegener.

Other Packages Related to srst2

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bowtie2

Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
dep: cd-hit

Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
dep: python3-scipy

Videnskabelige værktøjer for Python 3
dep: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

rec: python3-rpy2

Python 3-grænseflade til GNU R-sproget og miljøet - version 2

Download srst2

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	59.8 kB	265.0 kB	[list of files]