all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: python-pyfaidx  ]

Package: python-pyfaidx-examples (0.5.5.2-1)

Links for python-pyfaidx-examples

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package python-pyfaidx:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Dataeksempel for effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python

Samtools tilbyder en funktion »faidx« (FAsta InDeX), der opretter en lille flad indeksfil ».fai« der tillader hurtig vilkårlig adgang til enhver undersekvens i den indekserede FASTA-fil, mens der indlæses en minimal mængde af filen i hukommelsen. Dette Pythonmodul implementerer rene Pythonklasser for indeksering, indhentelse og på stedet ændring af FASTA-filer via et samtools-kompatibelt indeks. Modulet pyfaidx er API-kompatibelt med pygr seqdb-modulet. Et kommandolinjeskript »faidx« er installeret sammen med modulet pyfaidx og faciliterer kompleks manipulering af FAST-filer uden nogen programmeringsviden.

Denne pakke tilbyder eksempler på data til at teste Pythonmodulerne.

Other Packages Related to python-pyfaidx-examples

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download python-pyfaidx-examples

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 46.1 kB66.0 kB [list of files]