all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: simka  ]

Package: simkamin (1.5.3-4)

Links for simkamin

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package simka:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Omtrentlig komparativ metagenomikmetode dedikeret til NGS-datasæt

Simka er et de nove-komparativt metagenom-værktøj. Simka repræsenterer hvert datasæt som et k-mer-spektrum og beregner flere klassiske økologiske afstande mellem dem.

Forskellen til Simka består i at SimkaMin fremstiller omtrentlige (men meget lig) resultater ved at undersample kmer-rummet. Med denne strategi og med stadardparametre er SimkaMin væsentlig hurtigere, bruger 10 gange mindre hukommelse og 70 gange mindre diskplads end Simka.

Other Packages Related to simkamin

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download simkamin

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 31.3 kB385.0 kB [list of files]