[ Source: multiqc ]
Package: multiqc (1.9+dfsg-3)
Links for multiqc
Debian Resources:
Download Source Package multiqc:
- [multiqc_1.9+dfsg-3.dsc]
- [multiqc_1.9+dfsg.orig-debian-tests-data.tar.xz]
- [multiqc_1.9+dfsg.orig.tar.xz]
- [multiqc_1.9+dfsg-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [multiqc.info]
Similar packages:
Vis integration for RNS-sekventering på tværs af værktøjer og prøver
Sekventeringen af DNA eller RNA med nuværende teknologier med høj gennemløb involverer en række værktøjer og disse anvendes over en række prøver. Det er nemt at miste overblikket. Og indsamling af dataene og at sende dem videre på en læsbar måde til de individer der foretog prøverne er en udfordring for et værktøj i sig selv. Men her er det. MultiQC opsamler resultatet fra være værktøjer i en enkelt rapport.
Rapporter oprettes ved at skanne mapper for genkendte logfiler. Disse fortolkes og en enkel HTML-rapport oprettes, der summerer statistikken for alle logge fundet. MultiQC-rapporter kan beskrive flere analysetrin og et stort antal prøver i et enkelt plot og flere analyseværktøjer gør det ideelt for rutinemæssige kvalitetskontrol i høj fart.
Other Packages Related to multiqc
|
|
|
|
-
- dep: fonts-glyphicons-halflings
- Ikoner lavet for mindre grafik
-
- dep: libjs-bootstrap
- HTML, CSS og JS-ramme
-
- dep: libjs-jquery
- JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer
-
- dep: libjs-jquery-tablesorter
- Fleksibel klientorienteret tabelsortering - jQuery-udv.modul
-
- dep: libjs-jquery-ui
- Brugerfladebibliotek til JavaScript for dynamiske internetprogrammer
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-click
- Omslag omkring optparse for kommandolinjeredskaber - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- Farvelagt terminal for Python 3's logningsmodul
-
- dep: python3-distutils
- Distutils-pakke for Python 3.x
-
- dep: python3-future
- Simpel single-source-understøttelse for Python 3 og 2 - Python 3.x
-
- dep: python3-humanfriendly (>= 8.1-2)
- Python 3-bibliotek til at lave brugervenlige tekstgrænseflader
-
- dep: python3-jinja2
- Lille men hurtigt og letanvendelig enkeltstående skabelon-generator
-
- dep: python3-lzstring
- LZ-baseret komprimeringsalgoritme for Python - Python 3-version
-
- dep: python3-markdown
- Tekst til HTML-konverteringsbibliotek og værktøj - Python 3-version
-
- dep: python3-matplotlib
- Pythonbaseret plotsystem i en stil svarende til Matlab - Python 3
-
- dep: python3-networkx
- Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk - Python 3
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-requests
- Elegant og simpelt HTTP-bibliotek for Python3, bygget for mennesker
-
- dep: python3-simplejson
- Simpel, hurtig, udvidelig JSON-koder/afkoder for Python 3.x
-
- dep: python3-spectra
- Easy color scales and color conversion for Python (Python 3 version)
-
- dep: python3-yaml
- YAML-fortolker og udleder for Python 3
-
- rec: libjs-filesaver
- Klientside, HTML5-bibliotek til at gemme lokale filer
-
- rec: node-clipboard
- Node.js module to copy to clipboard without flash
-
- rec: pandoc
- Generelt værktøj til konvertering af opmærkning
-
- rec: texlive-xetex
- TeX Live - XeTeX og pakker
-
- enh: adapterremoval
- Hurtig adaptertrimming, identifikation og læsesammenføjning af gensekvenser
-
- enh: afterqc
- Package not available
-
- enh: bamtools
- Værktøjssæt for manipulering af BAM-filer - sammenligning af arvemasser
-
- enh: bbmap
- Kort læsning-sammenligningsprogram og andre bioinformatikværktøjer
-
- enh: bcftools
- Genomisk variantkald og manipulering af VCF/BCF-filer
-
- enh: bcl2fastq
- Package not available
-
- enh: biobambam2
- Værktøjer for tidlig trin behandling af sammenligningsfil
-
- enh: biobloomtools
- Package not available
-
- enh: biscuit
- Package not available
-
- enh: bismark
- Package not available
-
- enh: bowtie
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- enh: bowtie2
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- enh: busco
- Sammenligningssæt af universelle ortologer i en enkelt kopi
-
- enh: clipandmerge
- Package not available
-
- enh: clusterflow
- Package not available
-
- enh: conpair
- Package not available
-
- enh: cutadapt
- Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb
-
- enh: damageprofiler
- Package not available
-
- enh: dedup
- Package not available
-
- enh: deeptools
- Package not available
-
- enh: disambiguate
- Package not available
-
- enh: dragen
- Package not available
-
- enh: fastp
- Ultrahurtig alt i en FASTQ-forbrænder
-
- enh: fastq-screen
- Package not available
-
- enh: fastqc
- Kvalitetskontrol for høj gennemløb af sekvensdata
-
- enh: featurecounts
- Package not available
-
- enh: fgbio
- Package not available
-
- enh: flash
- Fast Length Adjustment of SHort reads
-
- enh: flexbar
- Fleksibel stregkode og adapterfjernelse for sekvensplatforme
-
- enh: gatk
- Package not available
-
- enh: goleft-indexcov
- Package not available
-
- enh: happy
- Fortolkeropretter for Haskell
-
- enh: hicexplorer
- Package not available
-
- enh: hicpro
- Package not available
-
- enh: hicup
- Package not available
-
- enh: hisat2
- Grafbaseret sammenligning af korte nukleoide læsninger for mange genomer
-
- enh: homer
- Package not available
-
- enh: htseq
- Package not available
-
- enh: interop
- Package not available
-
- enh: ivar
- Funktioner brugt bredt for viral amplicon-baseret sekventering
-
- enh: jellyfish
- Tæl k-mers i DNA-sekvenser
-
- enh: kaiju
- Package not available
-
- enh: kallisto
- Næsten optimal RNA-Seq-kvantificering
-
- enh: kat
- Package not available
-
- enh: kraken
- Tildeling af taksonomiske etiketter til korte DNA-sekvenser
-
- enh: leehom
- Package not available
-
- enh: longranger
- Package not available
-
- enh: macs2
- Package not available
-
- enh: malt
- Package not available
-
- enh: methylqa
- Package not available
-
- enh: minionqc
- Package not available
-
- enh: mirtop
- Mærk miRNA'er med et standardnavn mirna/isomir
-
- enh: mirtrace
- Package not available
-
- enh: mosdepth
- BAM/CRAM depth calculation biological sequencing
-
- enh: mtnucratio
- Package not available
-
- enh: multivcfanalyzer
- Package not available
-
- enh: peddy
- Package not available
-
- enh: phantompeakqualtools
- Package not available
-
- enh: picard-tools
- Kommandolinjeværktøjer til at manipulere SAM- og BAM-filer
-
- enh: preseq
- Package not available
-
- enh: prokka
- Hurtig annotaton af prokaryotiske genomer
-
- enh: pycoqc
- computes metrics and generates Interactive QC plots
-
- enh: qorts
- Package not available
-
- enh: qualimap
- Package not available
-
- enh: quast
- Package not available
-
- enh: rna-seqc
- Package not available
-
- enh: rna-star
- Ultrahurtig univerel RNA-seq-sammenligningsprogram
-
- enh: rockhopper
- Package not available
-
- enh: rsem
- RNA-Seq ved Expectation-Maximization
-
- enh: rseqc
- Package not available
-
- enh: salmon
- Wicked-hurtig transskriptkvantificering fra RNA-seq-data
-
- enh: samblaster
- Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger
-
- enh: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- enh: sargasso
- Package not available
-
- enh: seqyclean
- Package not available
-
- enh: sexdeterrmine
- Package not available
-
- enh: sickle
- Vinduesopdelt adaptiv trimmingværktøj for FASTQ-filer der bruger kvalitet
-
- enh: skewer
- Efterbehandling af høj-gennemløb DNA-sekvenslæsninger
-
- enh: slamdunk
- Package not available
-
- enh: snpeff
- Package not available
-
- enh: snpsplit
- Package not available
-
- enh: somalier
- Package not available
-
- enh: sortmerna
- Værktøj til at filtrere, oversætte og OTU-udvælge NGS-læsninger
-
- enh: stacks
- Datakanal for bygning af loci fra kort-læs DNA-sekvenser
-
- enh: supernova
- Package not available
-
- enh: theta2
- Package not available
-
- enh: tophat
- Package not available
-
- enh: trimmomatic
- Fleksibelt værktøj til læsetrimning af Illumina NGS-data
-
- enh: varscan2
- Package not available
-
- enh: vcftools
- Samling af værktøjer til arbejdet med VCF-filer
-
- enh: verifybamid
- Package not available
Download multiqc
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 541.2 kB | 2,421.0 kB | [list of files] |