all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: e-mem  ]

Package: e-mem (1.0.1-4)

Links for e-mem

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package e-mem:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Effektiv beregning af Maximal Exact Matches for meget store genomer

E-MEM aktiverer effektiv beregning af Macimal Exact Matches (MEM'er), som ikke bruger fuld tekst-indeks. Algoritmen bruger meget mindre plads og er meget modtagelig for parallelisering. Den kan beregne alle MEM'er med minimumslængden 100 mellem hele menneske- og musegenomet på en 12-kerne maskine på 10 min. og med 2 GB hukommelse; den krævede hukommelse kan være så lav som 600 MB. Kan effektivt behandle genomer i alle størrelser. Omfattende test og sammenligning med de i øjeblikket bedste algoritmer er indeholdt.

Mummer har mange forskellige skripter, hvor et af nøgleprogrammerne er MEM- beregning. I alle skripterne, kan MEM-beregningsprogrammet nemt erstattes med e-mem for bedre ydelse.

Other Packages Related to e-mem

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download e-mem

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
i386 40.2 kB117.0 kB [list of files]