all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: bio-eagle  ]

Package: bio-eagle (2.4.1-3 and others)

Links for bio-eagle

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package bio-eagle:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Haplotype-udfasning inden for en genotypekohorte eller ved hjælp af et trinvist henvisningspanel

Eagle anslår haplotypefase enten inden for en genotypekohorte eller ved hjælp af et gradvist referencefelt. Den grundlæggende ide i Eagle1-algoritmen er at udnytte identitet-efter-afstamning blandt fjerne slægtninge - som er udbredt til meget store prøvestørrelser, men sjælden blandt mindre antal prøver - til hurtig kaldfase ved anvendelse af en hurtig bedømmelsestilgang. I modsætning hertil analyserer Eagle2-algoritmen en fuld probabilistisk model, der svarer til den diploide Li-Stephens-model, der anvendes af tidligere HMM-baserede metoder.

Bemærk venligst: Den kørbare fil blev omdøbt til bio-eagle på grund af navnesammenfald. Læs mere om dette i /usr/share/doc/bio-eagle/README.Debian.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to bio-eagle

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download bio-eagle

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
i386 2.4.1-3+b1 244.9 kB674.0 kB [list of files]