all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: python-bx  ]

Package: python3-bx (0.9.0-1 and others)

Links for python3-bx

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package python-bx:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download python3-bx

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 0.9.0-1+b2 1,880.5 kB4,739.0 kB [list of files]
arm64 0.9.0-1+b2 1,837.3 kB5,231.0 kB [list of files]
armel 0.9.0-1+b2 1,824.7 kB4,508.0 kB [list of files]
armhf 0.9.0-1+b2 1,837.1 kB4,120.0 kB [list of files]
i386 0.9.0-1+b2 1,900.9 kB4,871.0 kB [list of files]
mips64el 0.9.0-1+b2 1,803.1 kB5,421.0 kB [list of files]
mipsel 0.9.0-1+b2 1,808.4 kB5,294.0 kB [list of files]
ppc64el 0.9.0-1+b2 1,876.6 kB5,744.0 kB [list of files]
s390x 0.9.0-1+b2 1,823.4 kB4,727.0 kB [list of files]