Package: cwl-utils (0.22-1)

Redskaber for CWL-dokumenter

cwl-docker-extract - lagr eller præ-hent alle programcontaineraftryk refereret i en CWL CommandLineTool eller CWL Workflow (inklusive alle refererede CommandLineTools og sub-Workflows og så videre).

cwl-cite-extract - viser alle fundne programpakker (rekursivt) i det specificerede CWL-dokument.

cwl-expression-refactor - refaktorer CWL-dokumenter så at enhver CWL Expression-evaluering er adskilte trin (enten CWL ExpressionTools eller CWL CommandLineTools). Dette tillader afvikling af CWL-motorer, der ikke ønsker at understøtte indlejret udtryksevaluering uden for konkrete trin, eller ikke ønsker direkte at understøtte CWL's valgfri InlineJavascriptRequirement overhovedet.

cwl-graph-split - opdeler en pakke CWL-dokumentfil i flere filer. Pakkede XWL-dokumenter bruger $graph-konstruktionen til at indeholde flere CWL Process-objekter (Workflow, CommandLineTool, ExpressionTool, Operation). Typisk pakkede CWL-dokumenter indeholder en CWL Workflow under navnet »main« og arbejdsforløbtrinene (inklusive eventuelle underarbejdsforløb) [kræver cwlformat].

cwl-normalizer - normaliserer for et CWL-dokument alle dets afhængigheder i et enkelt JSON-format CWL-dokument, opgraderet til CWL version 1.2, efter behov. Kan valgfri refaktorere CWL-udtryk i separate trin i form af cwl-expression-refactor [kræver cwl-upgrader].

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):