всички настройки
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: libfastahack  ]

Пакет: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 и други)

Връзки за libfastahack0

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник libfastahack.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Други пакети, свързани с libfastahack0

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на libfastahack0

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 23,7 кБ82,0 кБ [списък на файловете]
amd64 1.0.0+dfsg-11 26,6 кБ87,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.0.0+dfsg-11 23,7 кБ87,0 кБ [списък на файловете]
armel 1.0.0+dfsg-11 23,0 кБ69,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1.0.0+dfsg-11 23,2 кБ57,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 27,6 кБ78,0 кБ [списък на файловете]
i386 1.0.0+dfsg-11 27,7 кБ81,0 кБ [списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 30,7 кБ117,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 25,1 кБ73,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1.0.0+dfsg-11 24,4 кБ90,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 26,4 кБ145,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1.0.0+dfsg-11 26,7 кБ87,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 1.0.0+dfsg-11+b1 24,8 кБ66,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1.0.0+dfsg-11 25,0 кБ77,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 27,9 кБ81,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 22,1 кБ1 051,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 1.0.0+dfsg-11 25,5 кБ69,0 кБ [списък на файловете]