Пакет: mash (2.1+dfsg-2)

Връзки за mash

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник mash.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [mash.readthedocs.io]

Подобни пакети:

fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.

Други пакети, свързани с mash

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libcapnp-0.7.0

Cap'n Proto C++ library
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

GCC support library
dep: libgsl23 (>= 2.5)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgslcblas0 (>= 2.4)

GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
dep: libmurmurhash1 (>= 1.1)

Portable MurmurHash Implementation
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

compression library - runtime

Изтегляне на mash

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
arm64	127,2 кБ	379,0 кБ	[списък на файловете]